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lammps下载软件(lammps软件安装教程)
2022-04-13 16:13  浏览:11

伴随着Windows的蓬勃发展,造出了Windows Subsystem for Linux这种神器,那么,接下来,就教教大家如何更好地在Windows10下安装及使用LAMMPS。

1.启用Windows10子系统

右键开始开始菜单,选择“程序和功能”,选择“启用或关闭Windows功能”,选择“适用于Linux的Windows子系统(Beta)”,确认,重启电脑。

再次进入桌面,右键开始开始菜单,选择“命令提示符(管理员)”,输入bash,输入y,设置你的账户名和密码(在后面sudo时,需要使用此密码)。

2.安装LAMMPS

右键开始开始菜单,选择“命令提示符(管理员)”,输入bash,接下来逐个拷贝并运行:

sudo apt-get update
sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps
sudo apt-get install lammps-daily 

至此,LAMMPS已经安装完成。

如将来需要更新LAMMPS,请输入:

sudo apt-get update

3.运行LAMMPS

首先,打开你的in所在文件夹,按住shift并单击右键,选择“在此处打开命令窗口(W)”,输入bash,输入:

lammps-daily < your.in

最后,回车,开始运算。

4.线程的环境变量设置

很多朋友经常会看到输出log.lammps文本内最上方有这么一行字:

OMP_NUM_THREADS environment is not set. Defaulting to 1 thread. (../comm.cpp:90)

这里简单地给出一个方法来设置线程 (OMP_NUM_THREADS):

首先,按住shift并单击右键,选择“在此处打开命令窗口(W)”,输入bash;

其次,输入:

sudo nano  ~/.bashrc

然后,进入此文档后,再使用键盘向下按键至页面尾部,回车一行输入:

export OMP_NUM_THREADS=4

完成文档编辑之后,按Ctrl+x退出,按y保存,回车;

最后,进入命令窗口,查看设置是否正确,输入:

echo $OMP_NUM_THREADS

如输出4,说明环境变量设置成功。

5.LAMMPS的安装位置、说明文件位置及示例算例位置

lammps-daily,执行文件位置:

 /usr/bin

doc,说明文件位置:

/usr/share/doc/lammps-daily-doc/doc

examples,示例算例文件位置:

/usr/share/doc/lammps-daily-doc/examples

#.后话

学习初期,用Windows10跑算例,一个算例一个bin,然后双击lmp_serial.exe进去,输入:

jump your.in

比较麻烦也比较苦恼。

学习中期,如写批处理命令(.bat),然后运行,实现了不用重复拷贝bin。

新建.txt文件,包含以下内容:

cd C:\LAMMPS\bin #Windows下安装地址
lmp_serial.exe <.././Compression\100\100_300K_COM\COM_100_300K.in #.in文件地址
cmd #保留窗口
注:#是注释的意思

再将.txt后缀改成.bat,右键.bat,选择以“管理员身份运行”。

现在这个方法,相比于前面两个方法更好,个人觉得此方法一劳永逸。

个人Linux水平有限,所以有很多问题还没有解决,希望解决的问题如下:

A.fftw安装,MPI安装;(这样安装的是预编译版本,即包含FFTW3和OpenMPI,此项完成)

B.OMP_NUM_THREADS环境变量设置。